dif.local                                              package: nenhum                                      R Documentation         

Lista com resultados de valor ecolgico para diferentes tipos de locais. 

Description:
Lista que apresenta os resultados, para cada tipo de local de coleta, dos ndices de diversidade de Shannon ou Simpson e de riqueza de Margalef, a partir de dados de abundncia, densidade e biomassa, calculados pela prpria funo e resultados de ANOVA para um parmetro ambiental determinado pelo usurio.

Usage:
dif.local <- function(ambiental, indice==shannon, anova.col=7)

Arguments:
ambiental: data.frame com as colunas na seguinte ordem, independente ao nome que se d a elas:
1 Coluna - Local (identificao do local de coleta);
2 Coluna  Ponto (Em cada tipo de local existem diferentes pontos de coleta  nmeros inteiros);
3 Coluna  Espcie (nome de cada espcie encontrada);
4 Coluna  n (nmero de indivduos por espcie, naquele determinado ponto);
5 Coluna  Pt (peso total dos indivduos de cada espcie determinado ponto);
6 Coluna  rea (rea de cada ponto de coleta);
7 Coluna  Parmetro 1 (parmetro ambiental a ser analisado);
...
n Coluna  Parmetro n (quantos parmetros o usurio tiver).
indice: ndice de diversidade shannon ou simpson.
anova.col: nmero da coluna do data.frame a aplicar o teste de ANOVA. 

Details:
O nome do objeto de entrada deve ser ambiental.
Os ndices de diversidade sero calculados pelo pacote vegan.
O ndice de riqueza  calculado pela seguinte forma: nmero de espcies -1/nmero total de indivduos. Este ndice  calculado para cada tipo de local que o usurio tiver.
A funo s ir rodar um teste de ANOVA de cada vez para os parmetros ambientais, ou seja, caso o usurio queira verificar se existe diferena significativa de um outro parmetro ambiental entre os diferentes tipos de locais,  s alterar o nmero da coluna em que o outro parmetro est.

Value:
Todos os resultados gerados so calculados para cada tipo de local. O objeto de sada apresenta tanto data.frames com resultados de abundncia, densidade e biomassa e com os ndices de diversidade e riqueza quanto a tabela de ANOVA para o parmetro determinado.

Warning:
Mensagens de aviso sero geradas caso os dados no cumpram as premissas do teste de ANOVA (p<0.05), porm o teste ser feito independente do resultado das premissas.

Note:
Esta funo requer instalao do pacote vegan.

Author(s):
Marina Rito Brenha
marina.brenha@gmail.com

References:
MAGURRAN, A. E. 2004. Measuring biological diversity. Blackwell Science Ltd.: Oxford. 256p.
LEWIS, D. G. 1995. Anlise de Varincia. Harbra: So Paulo. 59p.

See Also:
Dvidas sobre os ndices de diversidade e ndice de riqueza, veja o help da funo diversity do pacote vegan. 

Examples:
Use como exemplo a planilha de dados ambientaldiflocal.txt.
ambiental <- read.table("ambientaldiflocal.txt", header=T, sep="\t", dec=".", as.is=T) ## guarda o arquivo no objeto de entrada ambiental

